রিলে ফসল হিসেবে আমন ধানের জমিতে খেসারি চাষ করা যায়। এটিকে পয়রা চাষও বলে। আমন ধান কাটার সপ্তাহ দুয়েক আগে জমিতে পর্যাপ্ত রস থাকা অবস্থায় বীজ ছিটিয়ে বুনতে হবে। তবে কখনোই কাদা থাকা অবস্থাতে নয়।
মাঠের পাকা ধান কাটার ১০-১২ দিন আগে জমিতে ছড়িয়ে দিলে অথাৎ রিলে ফসল হিসেবে চাষ করলে খেসারির বীজ লাগবে বিঘাপ্রতি ১৫-১৬ কেজি। উল্লেখ্য, খেসারির মতো মসুর, সরিষাও এভাবে বুনে চাষ করা যায়।
রিলে ফসলের ক্ষেত্রে আমন ধানের পরিপক্বতাকাল এবং জমির রসের পরিমাণের উপর খেসারির বীজ বপনের সময় নির্ভর করে। এক্ষেত্রে কার্তিক মাস থেকে মধ্য-অগ্রহায়ণ (মধ্য-অক্টোবর থেকে নভেম্বর) পর্যন্ত বীজ বপন করতে হবে।
পয়রা ফসলে বীজ বোনার ৩০-৪৫ দিনের মাথায় ২ শতাংশ ডিএপি দ্রবণ (এক লিটার পানিতে ২০ গ্রাম) স্প্রে করতে পারলে ভালো হয়। সার এক রাত ভিজিয়ে রাখলে আরো ভালো। ফুল আসার সময় ২ শতাংশ ইউরিয়া দ্রবণ (এক লিটার পানিতে ২০ গ্রাম ইউরিয়া) গাছে স্প্রে করলে ফলন বাড়ে।
সাধারণত জমির মাটিতে থেকে যাওয়া রসেই খেসারি চাষ হয়ে যায়। তবে ৬০-৭০ দিনের মাথায় একবার সেচের ব্যবস্থা করতে পারলে ফলন বেশ বাড়ে।